1994年成为深圳市第一批通过国家卫生部评审的“爱婴医院”

1995年通过国家卫生部医院评审委员会评审成为“二级甲等医院”

2002年正式挂牌“深圳市园林式花园式单位”

2003年烧伤整形科被南方报业集团和香港大公报授予“香港市民最信赖的内地特色专科”荣誉

2003年获得深圳市“抗击非典先进单位”

2004年妇产科被南方报业集团和香港大公报授予“香港市民最信赖的内地特色专科”荣誉

2008年被深圳市政府授予“绿色医院”称号

2008年获2007-2008年度“广东省五四红旗团支部（总支）先进集体”称号

2009年急诊科被评为广东省“巾帼文明岗”

2009年10月成为“广东医学院硕士研究生联合培养点”

2009年12月成为“广东省普通高等医学院校教学医院”

2010年11月成为“广东省特级档案综合管理单位”

2010年度荣获深圳市急救技术考核总评第一名

2010、2011年连续荣获“深圳市急救综合考核先进单位”称号

2010年度荣获“深圳市南山区红十字会先进集体”称号

2011年12月成为“广东省全科医学教育临床教学基地”

2011年、2012年连续两年获“深圳市医疗服务整体管理与质量控制评估二级医院组第一名”及“深圳市医疗服务和质量管理A级-单位”

2011年度荣获“深圳市红十字会先进集体”称号

2011年度荣获“深圳市院前急救综合考核先进单位”称号

2012年度荣获“深圳市创先争优‘鹏城先锋’先进基层党组织”称号

2013年7月成为深圳第一家、华南地区首家、国内第10家通过JCI认证的综合性公立医院; 2016年7月医院再次以高分通过了最新标准的JCI复审,获得JCI总部授予的复审金牌

2013-2016年被评为年度健康教育先进单位

2014-2015年被评为年度传染病预防控制工作先进单位

2014、2016年被评为年度儿童保健工作先进单位                     

2014、2018、2021年荣获“深圳市文明单位”称号

2014年度荣获中国药学会“2014年信息工作先进单位”称号

2015年深圳市整体质量评估中首次以三级医院资格参评即获得三级综合医院A-级单位，并在区属三级医院的评比中名列前茅。到2016年，医院已连续六年蝉联深圳市“医疗质量A-级单位”称号

2015年全市全年综合满意度排名中，在13个区属三级综合医院中排名第三

2015年荣获中华慈善总会颁发的“爱心医院”称号

2015/2017年荣获区计划生育先进单位光荣称号

2015年荣获“深圳市卫生计生统计工作先进单位”称号

2015年荣获“深圳市市妇幼卫生信息管理先进单位”称号

2016年4月被深圳市卫生和计划生育委员会核定为三级综合医院

2016年被评为深圳市社会保险定点医院AAA-信用等级单位

2016年成为深圳市中医特色专科（专病）建设单位

2016年4月21日，广东省家庭医生式服务团队师资骨干培训班在蛇口医院成功启动，医院成为省级家庭医生式服务团队师资培训基地

2016年被评选为广东药品交易医疗机构诚信榜单10强之一

2016年被评为年度医疗器械不良事件监测工作先进单位

2016年医院选送的“绿叶圈”荣获第四届全国医院品管圈大赛三等奖

2017年深圳湾社康中心被评为国家优质服务示范社区卫生服务中心

2017年南水社康中心被深圳市卫生计生委评为2017年度深圳市优质服务示范社区健康服务机构

2017年医院选送的“舌尖上的医院”荣获第五届全国医院品管圈大赛优秀奖

2017年被评为年度深圳市综合医院中医药工作先进单位

2017年深圳市南山区蛇口人民医院工会委员会被评为“先进职工之家”

2018年医院选送的“心梦圈”荣获广东省首届医院品管圈大赛三级医院综合组二等奖

医院被授予“2018年度改善医疗服务示范医院”；药剂科被评为“2018年度改善医疗服务先进科室”

2018年深圳湾社康被评为“全国优质服务示范社区卫生服务中心”并且代表深圳市接受由中央政治局委员、全国人大常委会副委员长王晨带队，全国人大常委会传染病防治法执法检查，得到了王晨副委员长的充分肯定和表扬；深圳湾社康也因多次取得优异成绩被区卫计局通报表扬

2018年医院获得南山区征兵办颁发的嘉奖令，成为深圳市唯一一家征兵体检示范工作站

2016-2022年连续七年蝉联深圳市“院前急救工作先进单位”，2018-2019年连续两年荣获急诊急救综合考核双“A”好成绩

医院被评为2018年度“深圳市卫生健康科教工作先进集体”

2019年医院获批增名“深圳市前海蛇口自贸区医院”，抢抓粤港澳大湾区发展机遇

2019年医院胸痛中心喜获深圳市胸痛中心质控评比第一名，并在年度质量检查评估中获得全市第一，全省第八好成绩

2019年医院顺利通过国家药品监督管理局医疗器械临床试验机构认证，拥有了首个国家级临床科研平台

2019年医院荣获南山区母乳喂养知识竞赛一等奖

2020年上半年被评为食源性疾病监测工作先进单位

2020年获批设立市级博士后创新实践基地

2020年更名“深圳市前海蛇口自贸区医院”，抢抓“三区”重大发展机遇，建设中国特色社会主义公立医院样板

2021年被评为食源性疾病监测工作先进单位

2022年，和华为、中国联通、梦网物联联合开发“5G助力大型医学隔离酒店智慧疫情防控”，获第五届“绽放杯”5G应用征集大赛全国二等奖

2022年成功通过标准版胸痛中心认证

2022年顺利完成PCCM国家规范化建设标准认证工作

2023年胸痛中心顺利通过国家胸痛中心标准版认证

2023年卒中中心喜获省卫健委“卒中防治中心”授牌

2023年顺利通过记忆防治中心现场评估

2023年2月22日，深圳市前海蛇口自贸区医院正式获批广东省“港澳药械通”第二批指定医疗机构，2023年6月28日完成首批“港澳药械通”获批药品英克西兰、阿培利司的交接，这是“港澳药械通”政策首次在深圳前海和南山落地实施，对进一步推动深港两地医疗资源的互通互联有着非常重要的意义